北京高碑店污水处理厂的好氧池即采用此方法。在这样的处理系统中，微生物细胞悬浮在所需处理的污水中，而不是形成“生物膜”那样的被固定起来。例如，氧化塘即是经典的悬浮细胞污水处理系统。氧化塘的效率较低，并需要较大的空间位置，氧化有机物所需的氧气来自于藻类的光合作用，主要通过扩散而被其它微生物吸收利用。这种系统中氧化作用通常不完全，因而常常产生较大的臭味。由于它是一个开放系统，所以它的处理效率受季节温度波动的影响很大，这种处理系统只能在温暖的地方使用。